吴遵晦，字明仲，号桂轩，浙江杭州府钱塘县人，民籍。嘉靖十九年（1540年）庚子科浙江乡试第八十八名举人。嘉靖三十二年（1553年）中式癸丑科二甲第三十二名进士。大理寺观政，授工部主事，升员外、郎中，调工部郎中，升山东临清兵备副使，四十五年被户科给事中张宪臣所劾，下巡按御史讯问。