孙世祐（1505年—1556年），字元吉，江西南昌府丰城县同造人，民籍。嘉靖七年（1528年）戊子科江西乡试第八十名举人，八年（1529年）中式己丑科会试第三百二十名，三甲第十名进士。授行人司行人，累官刑部山东司员外郎，十六年（1537年）四月升广东按察司佥事、兵备海北。历官云南右参议、湖广副使、贵州参政、湖广左参政、湖广按察使、湖广左布政使，二十九年（1550年）十月升都察院右副都御史、巡抚山西，未任，十一月调任总理粮储兼巡抚应天，丁母忧归。服阕，三十二年（1553年）六月起复都察院右副都御史、巡抚云南，三十三年（1554年）十二月升南京工部右侍郎，三十五年（1556年）四月改任刑部右侍郎，五月卒，赐祭葬。