方学龙，字叔允，号望山，浙江严州府淳安县人。万历十年（1582年）壬午科浙江乡试举人，十七年（1589年）己丑科进士。二十年（1592年）授广东顺德县知县，擢南京刑部郎中，升福建福州府知府，三十年（1602年）调漳州府知府。三十六年（1608年）八月升福建按察司副使、兵备福宁。