秦祐（1487年—？），字顺甫，号两溪，山东东昌府临清州人。正德十一年（1516年）山东乡试第七十四名举人。正德十二年（1517年）联捷丁丑科会试第一百五十二名，登第三甲第一百三十七名进士。都察院观政，授固始县知县，复除修武县，嘉靖四年（1525年）三月选授礼科给事中，六年九月因李福达案革职为民。