商周祚（1577年1月26日—17世纪），字明兼，号等轩，浙江绍兴府会稽县人。万历二十五年（1597年）以《诗经》中举人第二十八名，二十九年（1601年）会试第三名，中三甲进士，授福建邵武县知县。擢给事中，历太仆寺少卿，累官兵部侍郎。万历四十八年（1619年），擢都察院右佥都御史，巡抚福建，任内不徵民间一钱，抗击倭寇，擒斩盗贼。天启二年（1622年），荷兰人佔据澎湖，商周祚私下答应荷兰舰队司令雷约兹（Cornelis Reijersz），只要撤出澎湖，就允许他们在台湾贸易。最后商周祚命令南路副总兵张嘉策强行要求荷兰人撤返，“但师行粮从，无饷则无兵。”张嘉策被朝廷革职查办，改由俞咨皋接任。天启三年二月，朝廷以南居益取代商周祚出任福建巡抚。天启五年（1625年），任兵部右侍郎，两广总督。次年升任兵部尚书，以母年老，请求归养，乡居十载。崇祯十年（1637年），复任都察院右佥都御史。不久因屡违圣意被革职，返归故里。南明弘光政权时担任吏部尚书，于1646年（清顺治三年，南明隆武二年、监国鲁元年）六月降清。女儿商景兰嫁祁彪佳。