毛毓祥（？—17世纪），直隶常州府武进县人，明朝、南明政治人物。崇祯九年（1636年），毛毓祥举丙子科应天乡试，崇祯十年（1637年）联捷进士，授福建海澄知县，累官海北副使、广东按察使。隆武帝继位后召授左通政。李成栋反正，毛毓祥自通政使升任户部右侍郎，调任礼部，永历二年（1648年）晋刑部尚书。之后他见世事不可为，因此上奏家眷弟名帖，自陈愚惫辞官；后来隐居在苏州直到去世。